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种子发芽率除了来自种子本身的条件制约因素之外，还受到很多客观因素的影响。主要是一些自然条件和人为因素造成的影响。而种子发芽箱能尽可能的调节这些外部因素，是的种子能更健康的发芽，生长。制约种子发芽率的自然因子：因此，在做种子发芽试验时，充分考虑制约种子发芽率高低的内外因子，并Z大限度地来加以控制，实现客观、真实反映该批种子发芽率状况的目的也就显得尤为重要。
种子发芽箱（或智能光照培养箱）的使用,是提高种子发芽率的有效措施，但影响种子发芽率的因素有很多，主要表象在内部因素和外部因素。
种子发芽的内部因素主要有：种子成熟度和种子休眠，还有种子的含水量。
一般情况下种子越成熟发芽率相对来说越高；关于种子休眠，有些种子必须经过一段时间的休眠时间才能成熟，才能发芽，如苜蓿、银杏等。对于种子的含水量，在一定范围内和相同的试验条件下，种子本身含水量越高越有利于萌发。
种子发芽的外部因素主要有：种子发芽需要有水、温、气、光等条件。但是不同作物由于起源和进化的生态环境不同，其发芽所要求的条件也有所差异。
水分是种子发芽的关键性因素，没有水种子不能萌发，但是水分过多则会增加种子霉烂和病菌感染的几率。
温度：在适宜的温度条件下，种子发芽的温度控制有恒温和变温两种。具体采取哪种控温模式，要根据不同作物种子对温度的具体要求来定。
氧气：一般来说，发芽床上水分多、氧气少，则长芽；反之，水分少氧气多则宜于长根。
光照 ：作物种子发芽对光反应不同，一般分为需光型种子、需暗型种子和光不敏感型种子。实践中多数大田作物和蔬菜种子对光不敏感，在光照或黑暗条件下均能良好发芽，但还是采用光照。
像水分，温度，光照，氧气等这些因素会影响种子发芽率，大家觉得无可厚非，但是一些诸如在种子发芽过程中，类似清洗消毒不认真，加水不当，幼苗判定产生的误差，数据处理产生的误差之类的认为因素，可能就比较容易被忽略，因此，种子发芽箱与精密种子的配合使用，对种子发芽率的提升无疑是非常有帮助的。
